口腔溃疡虽然在日常生活中极为常见，也具有一定自限性，但也常是局部疾病和全身疾病在口腔的表征，由于溃疡的表现基本一致，要查明病因还需仔细进行鉴别。
1、手足口病：好发于儿童，患儿体温可升高至38℃，口腔黏膜的任何部位均可发生疱损，粟粒大小，密集或散在分布，疱破后形成的溃疡可达绿豆或黄豆大小，溃疡周围有红晕围绕。此外患儿手、足底等部位的皮肤也可出现粟粒大小的红斑、丘疹和小水疱。
2、梅毒：患者感染梅毒7-10周后由于螺旋体的感染和毒素作用，可出现黏膜斑损害，好发于颊、龈、舌腭、悬雍垂，呈灰白色亮面微隆的斑块，0.5-1.0cm，常为圆形、椭圆形或环形，易发生溃烂。
3、鳞癌溃疡：癌性口腔溃疡好发于舌腹舌缘、口角、软腭复合体，溃疡深浅不一，边缘不齐，底部菜花状周围及基底硬。此类口腔溃疡常伴有恶病质，有助于诊断。
4、疱疹性口炎：疱疹性口炎多见于婴幼儿，患儿口腔可出现簇状小疱疹，很快破溃形成成簇的浅表小溃疡，疼痛剧烈，颌下淋巴结肿大，同时伴有发热、寒战等全身症状。
5、带状疱疹病毒引起的口炎：带状疱疹病毒引起的口炎多见于中老年，患者口腔黏膜疱破后形成溃疡，皮肤疱破后结痂。
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